Molekylär epidemiologi för fästing-buren encefalitvirus (TBE)

Tick-borne encephalitis virus (TBEV) är ett neurotropt flavivirus som orsakar allvarliga infektioner i centrala nervsystemet. I detta forskningsprojekt kombinerar vi fältprover, patientprover, sekvensering och bioinformatik för att fördjupa kunskapen om virusets molekylära diversitet och patogenes.

Vi analyserar det genetiska innehållet hos TBE-virus isolerat från både fästingar och patienter, med syfte att kartlägga hur genetisk variation påverkar sjukdomsförloppet. Projektet bygger vidare på tidigare forskning om quasispecies och viral populationsstruktur i Skandinavien och utgör en central del av vår långsiktiga strategi för att förstå virusets evolution i relation till smittspridning och sjukdom.

Ett nytt doktorandprojekt vid Örebro universitet fokuserar på patientkopplade analyser av TBEV med hjälp av helgenomsekvensering, insamlat kliniskt material och immunologisk karakterisering. Inom projektet kombineras bioinformatik med molekylärbiologiska tekniker, och vi har nyligen startat arbete med att relatera genetiska virusvarianter till neuroinflammatoriska markörer.

Vi medverkar också i det norskledda projektet SE-TBE, som leds av Åshild Andreassen vid Folkehelseinstituttet (FHI) i Norge och finansieras av norska Helse- og omsorgsdepartementet (HOD) 2024–2026. Projektet omfattar både fästingövervakning och molekylära analyser av TBEV från patienter och vektorprover. Projektet stöds även av Region Örebro läns forskningskommitté, och bedrivs i samarbete med kliniska forskare, virologer och psykologer.

Utvalda publikationer:
Maharjan, U., Skudal, H.K., Asghar, N., Soleng, A., Johansson, M., Heggen Lindstedt, H.E., Koskela von Sydow, A., Pettersson, J.H.-O., Johansen, W., Fevang, B., Bjerkreim, R., Basnet, S., Vikse, R., Andreassen, Å.K., Alfsnes, K. (2025) Novel variants of tick-borne encephalitis virus from patient and tick samples in Norway. Ticks and Tick-borne Diseases In press

Kjær, L.J., Johansson, M., Lindgren, P.-E., Asghar, N., Wilhelmsson, P., Fredlund, H., Christensson, M., Wallenhammar, A., Bødker, R., Rasmussen, G., Kjellander, P. (2023). Potential drivers of human tick-borne encephalitis in the Örebro region of Sweden, 2010–2021. Scientific Reports, 13(1).

Wallenhammar, A., Lindqvist, R., Asghar, N., Gunaltay, S., Fredlund, H., Davidsson, Å., Andersson, S., Överby, A.K., Johansson, M. (2020). Revealing new tick-borne encephalitis virus foci by screening antibodies in sheep milk. Parasites & Vectors, 13(1).

Asghar, N., Pettersson, J.H.-O., Dinnetz, P., Andreassen, Å., Johansson, M. (2017). Deep sequencing analysis of tick-borne encephalitis virus from questing ticks at a hotspot in nature reveals similarities between quasispecies pools of the virus. Journal of General Virology, 98(3), 413–421.

Asghar, N., Lindblom, P., Melik, W., Lindqvist, R., Haglund, M., Forsberg, P., Överby, A., Andreassen, Å., Lindgren, P.-E., Johansson, M. (2014). Tick-borne encephalitis virus sequenced directly from questing and blood-feeding ticks reveals quasispecies variance. PLOS ONE, 9(7), e103264.