Translationell patogenomik

Translational Pathogenomics är en forskargrupp som fokuserar på att förstå och förbättra diagnostiken av både bakteriella och virala infektionssjukdomar med klinisk och samhällelig relevans. Vårt arbete befinner sig i skärningspunkten mellan molekylära metoder, bioinformatik, metagenomik och tillämpad klinisk mikrobiologi.

Vår forskning innefattar både riktade och breda analyser, såsom metagenomisk och metataxonomisk sekvensering av kliniska prover. Dessa kompletteras med bioinformatiska analyser för att identifiera mikrobiella och virala signaturer, resistensgener samt den taxonomiska sammansättningen i komplexa provmiljöer. En central del av vår verksamhet är att överbrygga gapet mellan laboratoriebaserad forskning och klinisk tillämpning. Genom att kombinera avancerad DNA- och RNA-sekvensering med skräddarsydda bioinformatiska pipelines i klinisk och epidemiologisk kontext, strävar vi efter att förbättra diagnostik, behandling och smittspårning för både bakteriella och virala infektioner.
Målet är att bidra till en mer precis och evidensbaserad infektionsdiagnostik för vården.