Projektbanken för Läkarprogrammet
Här presenteras studentprojekt för studenterna på Läkarprogrammet. I projektbanken kan du antingen söka på ämnesområden eller genom att skriva in sökord i sökrutan. Du kan också välja en bokstav och får då upp de projekt som börjar på den bokstaven i rubriken.
Projekt inom Infektion
-
Adhererar Neisseria meningitids som orsakat sjukdom eller bärarskap olika till humana epitelceller?
I projektet kommer vi undersöka hur bakterien Neisseria meningitidis (meningokocken) binder till epitelceller. Syftet med projektet är att se om det finns någon skillnad i hur invasiva- och bärarisolat binder till humana epitelceller. Inbindning till epitelceller sker med bland annat typ IV pili som finns på meningokockens yta.
Typ IV pili består framförallt av proteinet pilE som kodas av genen pilE. När invasiva- och bärarisolat har jämförts genetiskt har vi sett en skillnad i pilE mellan dessa isolat. där bärarisolaten verkar ha flera kopior av denna gen än de invasiva isolaten.
Våran frågeställning är då om detta kan påverka inbindningen till epitelcellerna och på så sätt påverka vid bärarskap eller invasiv sjukdom. I projektet kommer epitelceller odlas som sedan infekteras med meningokock isolat som har orsakat invasiv sjukdom och bärarisolat som vi har samlat in under en bärarstudie som utfördes på Örebro Universitet 2018-2019 (Mcbär).
Efter en inkubation kommer antalet bakterier på cellerna räknas för att se om det är någon skillnad i antalet bakterier som har bundit till cellerna mellan invasiva- och bärarisolat. Vi planerar att starta projektet i mitten av augusti och det kommer ta ca 10 veckor att utföra. Projektet är ett samarbete mellan iRiSC (Inflammatory Response and Infection Susceptibility Centre) och det nationella referenslabbet för meningokocker.
-
Molekylär karaktärisering av TBE virus
En av de allvarligaste fästingburna sjukdomarna är TBE (Tick-borne encephalitis), en virussjukdom som saknar specifik behandling och som kan leda till svår encefalit med livslånga kvarstående men, såsom förlamningar och kognitiva funktionsnedsättningar. Sedan 1990-talet har både antalet rapporterade fall och de endemiska områdena ökat kraftigt i Sverige och övriga Europa, och i dag rapporteras cirka 500 TBE-fall årligen i Sverige. Trots detta är den molekylära och epidemiologiska kunskapen om cirkulerande TBE-virus fortfarande begränsad, särskilt baserat på kliniska patientprover.
I Örebro har vi precis delvis lyckats sekvensera TBE-virus från ett kliniskt patientprov. Detta projekt syftar till att bygga vidare på detta arbete genom att utföra helgenomsekvensering av viruset. Den framtagna helgenomsekvensen kommer att användas som utgångspunkt för en jämförande analys med tidigare sekvenserade TBE-virus av europeisk subtyp som finns tillgängliga i GenBank. Genom fylogenetiska och bioinformatiska analyser av dessa sekvenser avses projektet belysa den genetiska variationen, evolutionen och spridningsmönster hos TBE-virus.
-
X-HiDE inflammationsforskning
Inflammation kan uppstå av många olika orsaker och ta sig olika skepnader. Den kan vara akut och kraftfull, som vid olika infektioner som sepsis eller ”cytokinstormen” vid covid-19. Vid låggradig kronisk inflammation är inflammationsförloppet svagt men inflammationen pågår under lång tid vilket kan leda till uppkomst av olika sjukdomar. Immunförsvaret kan också vara oförmöget att agera och upprätthålla sina viktiga funktioner vilket kännetecknar en immunoparalys. Efterhand som insikten om att inflammation kan orsakas av annat än bakterier och virus har också kunskapen växt om att inflammation är en underliggande orsak till uppkomsten av folksjukdomar, som cancer, diabetes och hjärt-kärlsjukdom men också vid depression och andra psykiska sjukdomar.
I X-HiDE studeras hur olika molekyler, celler och processer vid ett inflammatoriskt förlopp påverkar varandra med målet att förbättra diagnostik, prognos och behandling av många folksjukdomar. Forskningen utgår inte ifrån specifika sjukdomar, utan ställer i stället själva inflammationen i centrum genom att beskriva inflammationens olika skepnader, det vill säga olika grundtyper av inflammation. X-HiDE är en strategisk forskningsprofil vid Örebro universitet och vi kan erbjuda olika typer av projekt såsom experimentella studier, kliniska studier och systematiska litteraturöversikter.
Läs mer om X-HiDE på hemsidan: https://www.oru.se/strategiska-satsningar/strategiska-forskningsprofiler/x-hide/