Funktionella studier av flavivirus-Host värdcell-interaktioner

NS5 är ett centralt protein i flavivirusets livscykel och fungerar både som RNA-polymeras och virulensfaktor. Vi har visat att TBE-virus NS5 interagerar med värdproteiner för att blockera typ I‑interferonsignalering via JAK–STAT‑vägen (Werme et al., 2008). Dessutom kartlade vi NS5:s interaktioner med PDZ‑domänproteiner som Scribble, ZO‑1 och RIMS2, vilket påverkar cellpolaritet och neurala utvecklingsprocesser (Ellencrona et al., 2009; Wigerius et al., 2010).

I samarbete med Travis Taylors grupp vid University of Toledo har vi nyligen identifierat att TRIM21 och TRIM14 fungerar som antivirala faktorer. TRIM14 interagerar med både NS5 och NS3 – ett flaviviralt enzym med proteas- och helikasaktivitet – och påverkar därigenom virusreplikationen och värdcellens medfödda immunförsvar (Tran P. et al., 2025).

Vi har också studerat hur värdens Lunapark-protein påverkar flavivirusreplikation och cellulär membranorganisation, särskilt i relation till neurologisk påverkan vid infektion (Tran P. et al., 2021).

I våra studier används infektiösa kloner och repliconsystem för TBEV, Langatvirus och Zikavirus, i kombination med reverse genetics-verktyg, för att funktionellt kartlägga NS3- och NS5-aktivitet. Målet är att förstå hur molekylära virus–värd-interaktioner styr sjukdomsförlopp och att identifiera nya antivirala angreppspunkter.

Referenser i urval: 
Werme K, Wigerius M, Johansson M. Tick-Borne Encephalitis Virus NS5 associates with membrane protein Scribble and impairs interferon-stimulated JAK–STAT signaling. Cellular Microbiology. 2008;10(3):696–712.

Ellencrona K, Syed A, Johansson M. Flavivirus NS5 Associates with Host-Cell Proteins Zonula Occludens-1 and the Regulating Synaptic Membrane Exocytosis-2 Via an Internal PDZ Binding Mechanism. Biological Chemistry. 2009;390(3):319–323.

Wigerius M, Melik W, Elväng A, Johansson M. Rac1 and Scribble are targets in arrest of neurite outgrowth by TBE virus NS5. Molecular and Cellular Neuroscience. 2010;45(1):260–271.

Tran P, Asghar N, Taylor RT, Johansson M. Identification of TRIM21 and TRIM14 as Antiviral Factors Against Tick-Borne Flaviviruses. Viruses. 2025;17(5):644.

Tran P, Hartman L, Johansson M. Roles of the Endogenous Lunapark Protein during Flavivirus Replication. Viruses. 2021;13(9):1865.